一个完整的水体生态系统应包含种类及数量恰当的生产者、消费者和分解者，具体地说包括水生植物、鱼、虾、贝类等水生动物以及种类和数量众多的微生物。当污染物进入水体后由相应的微生物把它们逐步分解为无机营养元素，从而为水生植物的生长提供了营养。微生物在分解污染物过程的同时获得能量，得以维持自身种群的繁衍。水生植物一方面吸收水中无机营养元素，避免了水中无机物过量积累，另一方面植物的光合作用为水体中各生物种群提供了赖以生存的溶解氧，同时，水生植物是浮游植物食性和草食性水生动物的食物来源。因此水生植物（生产者）是水体中所有水生动物和微生物最主要的和最初的能量来源，其种类和数量在水体生态系统的平衡中起到至关重要的作用。

    水生动物（消费者）直接或间接以水生植物和微生物为食，可控制水生植物和微生物数量的过量增长，在保持水质清澈的过程中起重要作用。水生动物排泄的粪便和水生动、植物死亡后的尸体又为微生物（分解者）提供了食物来源，因此微生物是水体中的“清道夫”，它们为避免由水生生物带来的水体二次污染起着关键性的作用。 

    人工湖泊是在一定空间内，由生命系统和环境系统的多种因素，相互联系，相互制约，互为因果而组成的一个统一整体，即生态系统。人工湖泊生态系统是复杂的系统，这不仅是因为所受外部影响的复杂性，而且因为其内部运行机制及各因子的并联的复杂性。水色和透明度，随湖水化学成分的不同和水中悬浮物质及浮游生物的多少而变化，叶绿素a与湖水透明度之间存在着明显的负相关关系。要防止湖泊富营养化，根本的是控制污染物，即水体初级生产力营养性物质的负荷量。

    水生生态法主要依赖于湖泊生态系内能量流动和物质转移的动态变化，运用水生生物的食物（营养）关系，根据住宅小区水域地理位置、气象气候、水体大小、水位变化、湖底底质、湖泊形态、湖水运动特点、水质特征等实际情况，科学合理设计水生动物的放养模式（包括种类、数量、个体大小、食性、种间关系、生活习性等），可以直接吸收溶解的营养物质及有机碎屑，又可吃掉一些藻类，使各种群生物量和生物密度达到营养平衡水平，同时可以考虑种植一些观赏水生植物，不仅可以吸收水体中部分营养盐和有毒物质，降低湖泊中氮、磷浓度，优化水环境，维持水域生态平衡，而且还具有较高的观赏价值。